PFP Calculator

PFP

model_version='v3.0.0'がデフォルト値になっている.今後pfpのアップデートによりデフォルト値を変更したい場合, pfp_calculator のソースコードを変更する必要がある. もしくは次のようにmodel_versionを指定する

>>> pfp_calculator(model_version='v3.0.0')

PFPは3種類のDFT計算条件による学習データを持っています。これに対応して、計算モードと呼ばれる機能を提供しています. 計算モードを切り替えることによってどちらの学習データに合った挙動をするかを選べます。(Matlantisから引用)

• 使用方法

  from grrmpy import pfp_calculator
  atoms.calc = pfp_calculator()
  

  これは次のコードと同じ意味である.

  from pfp_api_client.pfp.calculators.ase_calculator import ASECalculator
  from pfp_api_client.pfp.estimator import Estimator, EstimatorCalcMode
  estimator = Estimator(calc_mode=EstimatorCalcMode.CRYSTAL_PLUS_D3)
  atoms.calc = ASECalculator(estimator)
  

  pfp_api_clientから呼び出すとコード量が多くなってしまうため,GRRMPYから簡単に呼び出せるようにした.

  またclaculatorを関数化することは様々なコードを書く上でも便利になることが多い.

  例えばIRC計算でcalculatorを付ける際にpfp_api_clientの場合

  i_step = atoms0.calc =
     estimator = Estimator(calc_mode=EstimatorCalcMode.CRYSTAL_PLUS_D3)
     atoms.calc = ASECalculator(estimator)
  

計算モード	説明
CRYSTAL	結晶系(Hubbard補正あり)
MOLECULE	分子系
CRYSTAL_PLUS_D3	結晶系(Hubbard補正あり)+DFT-D3補正
CRYSTAL_U0	結晶系(Hubbard補正なし)
CRYSTAL_U0_PLUS_D3	結晶系(Hubbard補正なし)+DFT-D3補正

grrmpy.calculator.pfp_calculator(model_version='v3.0.0', calc_mode='crystal_plus_d3')

PFP calculator

Parameters:

model_version: str

modelのバージョン

calc_mode: str

'crystal':

結晶系(Hubbard補正あり)

'crystal_plus_d3':

結晶系(Hubbard補正あり)+DFT-D3補正

'crystal_u0':

結晶系(Hubbard補正なし)

'crystal_u0_plus_d3':

結晶系(Hubbard補正なし)+DFT-D3補正

'molecule':

分子系