########################### 連続PinNEB計算 ########################### PinNEB計算の概要については :doc:`こちらを参照.` 基本操作 =========== .. code-block:: python from grrmpy.automate import AutoPinNEB # eq_listは最適化後のEQ構造のリスト # connectionsは [[0,1],[4,2],[3,1]]のような GRRMのCONNECTIONSに相当するリスト pin_neb = AutoPinNEB(eq_list,connections) pin_neb.run() 細かいパラメータを指定する ============================ パラメータの設定については :doc:`PinNEB` と同じ Tips ================ 意味のあるCONNECTIONSののみを抽出する ---------------------------------------- GRRMのTS,PT_list.logから意味のあるCONNECTIONSのみを抽出する. >>> from grrmpy.io import read_connections >>> from grrmpy.functions import get_unique_connections >>> original_connections = read_connections(ts_path) >>> connections,idx = get_unique_connections(original_connections) この操作によって - 同じ番号のCONNECTION ([0,0],[3,3]など) - 既にある組み合わせ ([0,1],[2,4],[1,0]の場合,最後の[1,0]は削除する) は削除される