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連続最適化計算 
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複数の構造最適化計算を連続的に行なう
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AutoOptのドキュメント: :class:`AutoOpt<grrmpy.automate.auto_opt.AutoOpt>`

基本的な使い方
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| 収束後のtrajファイルは"Structures"フォルダに保存される

.. code-block:: python
   :emphasize-lines: 3,10,11

    from grrmpy.visualize import *
    from grrmpy.io import log2atoms
    from grrmpy.automate import AutoOpt
    from grrmpy.optimize import FIRELBFGS

    log = "XXX_EQ_list.log"
    com = "XXX.com"
    poscar = "POSCAR"
    eqs = log2atoms(log, com, poscar) # GRRMのデータからEQ構造を読み込む
    opt = AutoOpt(eqs,optimizer=FIRELBFGS)
    opt.run()

GRRMのデータの読み込みには :class:`log2atoms<grrmpy.io.read_listlog.log2atoms>` を用いた.

計算後のデータの取り込み
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収束後の構造はStructuresフォルダに保存されているので 
:class:`read_traj<grrmpy.io.read_traj.read_traj>` を用いてデーターを取り出す

>>> from grrmpy.io import read_traj
>>> opted_eq_list = read_traj("Structure") # trajが存在するフォルダ名を指定

細かいパラメータを指定する
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| 例えば(maxstep=0.05,steps=200)→(maxstep=0.1,steps=1000)→(maxstep=0.2,steps=20000)の条件で計算するには

>>> run(maxstep_list=[0.05,0.1,0.2],steps_list=[200,1000,20000])

その他のパラメータは :class:`AutoOpt<grrmpy.automate.auto_opt.AutoOpt>` を参照

途中から計算を開始する
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| XXX_EQ_listを更新して,新たにEQの最適化をしたい時があるだろう.
| 例えば,以前の計算でEQ13まで計算してあり,新たにEQ14から計算をしたい場合には `restart` を指定して計算を途中から行なう.

>>> run(restart=14)