################ Convモジュール ################ .. module:: grrmpy.conv Atomsオブジェクト --> molオブジェクト ------------------------------------- .. autofunction:: grrmpy.conv.atoms2mol.atoms2mol .. autofunction:: grrmpy.conv.atoms2mol.atomslist2mols Atomsオブジェクト --> SMILES ------------------------------------- SMILESは結合情報有しているが,結合の有無はase.geometry.analysis.Analysisで判断している. だたし,単結合,二重結合等の判断はできないので全て単結合とみなしてSMILESに変換する. .. autofunction:: grrmpy.conv.atoms2smiles.atoms2smiles .. autofunction:: grrmpy.conv.atoms2smiles.atomslist2smileses molオブジェクト --> PNGのバイナリデータ --> UTF-8 ----------------------------------------------------- .. autofunction:: grrmpy.conv.mol2png_binary.mol2png_binary